学科(方向)：肿瘤生物信息学、医疗大数据

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通信地址：厦门大学翔安校区生命科学学院黄朝阳楼A210

教育背景与工作经历：

2019.9-至今   助理教授(特任副研究员/硕士生导师) 厦门大学生命科学院

2016.8-2019.7   理学博士 清华大学

生物学 (肿瘤生物信息学;蛋白质组学研究方向)    

2013.9-2016.7  理学硕士   福建医科大学

生物化学与分子生物学(肿瘤生物信息学研究方向)   

2009.9-2013.7  理学学士 福建医科大学  

药学专业

研究领域：

主要从事肿瘤生物信息转化医学研究，具体内容如下:

(1)利用生物信息学技术整合分析多维组学数据(基因组/转录组/表观基因组/单细胞转录组/单细胞质谱成像等)，筛选肿瘤分子标志物与药物靶点

(2)肿瘤蛋白质组/磷酸化组质谱数据个体化分析

(3)蛋白质修饰位点功能预测

项目经历：

主持项目:

(1)主持国家自然青年科学基金项目:

基于单细胞基因表达秩序关系识别结直肠癌复发风险标志物  负责人
(2)主持福建省青年科技人才创新项目:

基于单细胞基因表达秩序关系识别消化道恶性肿瘤分子标志物 负责人

(3)主持厦门大学校长基金培育项目：

肿瘤微环境的单细胞转录组数据分析及在预后与药效预测中的应用  负责人

(4)主持厦门大学汪德耀优秀研究生奖学金项目：基于转录组与数字病理辅助诊断原发灶不明组织来源 负责人

参与项目:

(1) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 32070635, 哺乳动物发育过程中基因表达对增强子依赖性的系
统评估 参与
(2) 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 81602738, 早期肝细胞癌预后亚型的多维组学特征及
亚型相关的细胞系鉴定 参与

(3)腾讯科技（深圳）有限公司，横向项目，校合20213160A0158，单细胞测序智能分析平台开发参与

学术成果：

l 已接收/发表SCI论文

1. Yachen Liu , Yalan Lin, Yuxiang Lin, Yujuan,Wu, Zheyang Zhang, Nuoqi Lin, Xianlong Wang, Mengsha Tong*, Rongshan Yu*. Application of individualized differential expression analysis in human cancer proteome (2022.2.23, Accept on Briefings in Bioinformatics

2.Mengsha Tong#; Chunyu Yu#; Jinwen Shi#; Wenwen Huang#; Sai Ge#; Mingwei Liu; Lei;Song; Dongdong Zhan; Xia Xia;Wanlin Liu; Jinwen Feng; Wenhao Shi;Jiafu Ji; Jing Gao; Tieliu Shi; Weimin Zhu;Chen Ding; Yi Wang; Fuchu He*; Lin Shen*; Tingting Li*; Jun Qin*; Phosphoproteomics Enables Molecular Subtyping and Nomination of Kinase Candidates for Individual Patients of Diffuse-Type Gastric Cancer, iScience, 2019, 22: 44–57

3.Mengsha Tong#; Chunyu Yu #; Dongdong Zhan; Ming Zhang; Bei Zhen; Weimin Zhu; Yi Wang; Congying Wu; Fuchu He*; Jun Qin*; Tingting Li*; Molecular subtyping of cancer and nomination of kinase candidates for inhibition with phosphoproteomics: reanalysis of CPTAC ovarian cancer, EBioMedicine, 2018, 40 (2352-3964): 305-317

4.Mengsha Tong#; Weicheng Zheng#; Hongdong Li; Xiangyu Li; Lu Ao; Yifeng Shen; Qirui Liang; Jing Li; Guini Hong; Haidan Yan; Hao Cai; Mengyao Li; Qingzhou Guan; Zheng Guo*; Multi-omics landscapes of colorectal cancer subtypes discriminated by an individualized prognostic signature for 5-fluorouracil-based chemotherapy, Oncogenesis, 2016, 5(2157-9024)

5.Yifeng Shen#; Mengsha Tong#; Qirui Liang; Huaqin Sun; Weicheng Zheng; Lu Ao; Zheng Guo*; Feifei She*; Epigenomics alternations and dynamic transcriptional changes in responses to 5-fluorouracil stimulation reveal mechanisms of acquired drug resistance of colorectal cancer cells, The Pharmacogenomics Journal 2017, 18 (1470-269X): 23-28

6. GaiGai Guo, Zhouyong Gao, Mengsha Tong, Dongdong Zhan,Guangshun Wang, Yi Wang, Jun Qin*. NQO1 is a determinant for cellular sensitivity to anti-tumor agent Napabucasin American Journal of Cancer Research 2020;10(5):1442-145