刘向荣博士
厦门大学信息学院计算机科学系，教授，博士生导师，副系主任。主要研究方向为计算理论，智能算法，数据挖掘，生物信息处理，移动与微传感技术等。近年发表SCI收录论文四十多篇，其中包括Bioinformatics、Information Science、IEEE TNB、Briefings in Bioinformatics、中国科学院院刊、中国科学、计算机学报等学术期刊。多次担任Bioinformatics、IEEE TNB、中国科学等杂志审稿人，受邀担任BICTA、ACMC等国际会议程序委员会委员。主持包括国家自然科学基金、十三五国家海洋经济创新发展区域示范项目子项目、重点研发计划政府间专项子课题在内的多个国家和企业科研项目，获省自然科学奖一等奖、省科技进步奖二等奖和教育部自然科学二等奖各1项，获厦门市重点人才等荣誉称号。
Email: xrliu@xmu.edu.cn
地址: 信息学院计算机科学系
厦门大学
厦门市思明区思明南路422号 361005
中国
工作经历:
2019.4至2020.4 厦门大学，发展规划办，副主任（挂职）
2018.8至今 厦门大学，信息学院，计算机系，副系主任
2015.7至今 厦门大学，信息学院，计算机系，教授
2014.7至2015.7 伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，电子与计算机工程系，访问学者
2011.7至2012.8 江苏省常熟市支塘镇，副镇长（科技副镇长，挂职）
2009.8至2015.7 厦门大学，信息学院，计算机系，副教授
2007.7至2009.7 北京大学，信息学院，计算机系，博士后
教育经历:
2001.9至2007.6 华中科技大学，控制系，硕博连读，工学博士
1996.9至2000.7 华中理工大学，生物医学工程系，工学学士
科研经历（近三年，主持）:
2021-2024 国家自然科学基金面上项目，基于网络表征学习的微生物数据计算分析方法及其体外仿真验证（62072384，负责人，57万）
2020-2020 企业横向，X光分选机应用软件开发（负责人，31万）
2020-2020 企业横向，基于国产智能芯片编程语言的水下环境重建与敏感目标识别应用开发及测试（负责人，40万）
2019-2020 重点实验室访问（开放）基金课题，大黄鱼重要经济性状表型自动化测量系统研发（负责人，10万）
2020-2022 企业横向，厦门大学信息学院兆易创新GD32 MCU联合实验室（负责人，85万）
2019-2021 企业横向，高功率激光加工成套系统开发（参与，100万）
2019-2021 国家重点研发计划政府间专项，项目名称：基于DNA自组装复合纳米孔技术的生物大分子检测（2017YFE0130600, 子课题负责人，45万）
2016-2019 十三五国家海洋经济创新发展区域示范项目：“海洋生态环境观测装备研发公共服务平台”(16PFW034SF02)-子项目“大型科研仪器智能监测组件”（负责人，200万）
2015-2018 国家自然科学基金面上项目：基于核酸系统的复杂分子逻辑电路研究（61472333，负责人，84万）
荣誉：
2007年，湖北省自然科学奖一等奖：非传统高性能计算中的生物计算理论（第4完成人）
2007年，湖北省科技进步奖二等奖：带中间包加热的水平连铸机及控制系统（第5完成人）
2008年，教育部自然科学奖二等奖：网络结构与优化中的智能计算方法研究（第11完成人）
2012年，江苏省苏州市优秀科技镇长团员（第四批）
2018年，厦门市重点人才
近五年主要论文:
1. Xiaoping Min, Congmin Ye, Xiangrong Liu, Xiangxiang Zeng, Predicting enhancer-promoter interactions by deep learning and matching heuristic, Briefings in Bioinformatics,2020, doi:10.1093/bib/bbaa254
2. Shuting Jin#, Xiangxiang Zeng#, Feng Xia, Wei Huang, Xiangrong Liu*,Application of Deep Learning Methods in Biological Networks, Briefings in Bioinformatics , 2020, doi: 10.1093/bib/bbaa043
3. Yun Zuo, Jianyuan Lin, Quan Zou, Min Jiang*, Xiangrong Liu*, 2lpiRNApred: A 2-layer integrated algorithm for identifying piRNAs and their functional based on LFE-GM feature selection, RNA Biology, 2020, 10.1080/15476286.2020.1734382
4. Xiangrong Liu,Yanzi Du,Min Jiang,Xiangxiang Zeng,Multi-objective Particle Swarm Optimization Based on Network Embedding for Complex Network Community Detection, IEEE Transactions on Computational Social Systems,2020,DOI: 10.1109/TCSS.2020.2964027
5. Jianyuan Lin, Xiangxiang Zeng, Yun Zuo, Ying Ju*, Xiangrong Liu*. A Deep Neural Network for Antimicrobial Peptide Recognition[C]//2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE, 2019: 82-85 (CCF B类会议)
6. Xiangxiang Zeng, Siyi Zhu, Xiangrong Liu, YadiZhou, Ruth Nussinov, Feixiong Cheng, deepDR: A network-based deep learning approach to in silico drug repositioning, Bioinformatics, 2019, btz418, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz418 (JCR一区，CCF B类，IF=5.4)
7. Zengyan Hong, Xiangxiang Zeng*, Leyi Wei*, Xiangrong Liu*,Identifying Enhancer-Promoter Interactions with Neural Network Based on Pre-trained DNA Vectors and Attention Mechanism ,Bioinformatics,2019,DOI:10.1093/bioinformatics/btz694 (JCR一区，CCF B类，IF=5.4，Corresponding）
8. Francis George C. Cabarle, Ren Tristan A.de la Cruz, Dionne Peter P.，Caili pan, Defu Zhang, Xiangrong Liu*, Xiangxiang Zeng*, Representations Of Spiking Neural P Systems With Rules On Synapses, Information Sciences, 2019,501:30-49, DOI: 10.1016/j.ins.2019.05.070 (JCR一区，CCF B类，IF=4.3，Corresponding）
9. 柳娟, 曹茂华,徐志达,林袁,刘向荣*, 基于选择集成学习的表面增强拉曼光谱检波算法,广州大学学报(自然科学版）, 2019,18(1):37-49
10. Kaiyang Qu, Fei Guo, Xiangrong Liu, Yuan Lin*, Quan Zou*, Application of Machine Learning in Microbiology, Frontiers in Microbiology,2019, 10: 827, (JCR二区，IF=4.02)
11. Yuan Lin#, Yinyin Cai, Juan Liu#, Chen Lin, Xiangrong Liu*, An advanced approach to identify antimicrobial peptides and their function types for penaeus through machine learning strategies, BMC Bioinformatics, 2019, DOI:10.1186/s12859-019-2766-9 , (JCR二区，CCF C类，IF=2.4，Corresponding)
12. Xiangrong Liu, Zengyan Hong, Juan Liu, Yuan Lin, Alfonso Rodríguez-Patón, Quan Zou*, Xiangxiang Zeng*, Computational methods for identifying the critical nodes in biological networks, Briefings in Bioinformatics, 2019, DOI: 10.1093/bib/bbz011 , (JCR一区，CCF B类，IF=6.3)
13. Cabarle FGC, de la Cruz RTA, Zhang X, Jiang M, Liu X*, Zeng X* ,On String Languages Generated by Spiking Neural P Systems with Structural Plasticity, IEEE Trans Nanobioscience. 2018,17(4):560-566. DOI: 10.1109/TNB.2018.2879345, (JCR三区，IF=2.16，Corresponding)
14. Quan Zou, Gang Lin，Xingpeng Jiang, Xiangrong Liu*, Xiangxiang Zeng*，Sequence clustering in bioinformatics: an empirical study, Briefings in Bioinformatics,2018, DOI:10.1093/bib/bby090 , (JCR一区，CCF B类，IF=6.3，Corresponding)
15. Wenying He,Ying Ju, Xiangxiang Zeng, Xiangrong Liu*, Quan Zou*, Sc-ncDNAPred: A sequence-based predictor for identifying non-coding DNA in Saccharomyces cerevisiae, Frontiers in Microbilogy, DOI: 10.3389/fmicb.2018.02174, (JCR二区，IF=4.02，Corresponding)
16. Chen R, Liu X, Jin S, Lin J, Liu J*, Machine Learning for Drug-Target Interaction Prediction, Molecules, 2018; 23(9):220 8, (JCR三区，IF=3.0)
17. Liu B, Han L, Liu X, et al. Computational prediction of sigma-54 promoters in bacterial genomes by integrating motif finding and machine learning strategies. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology & Bioinformatics, 2018, 99:1-1, (JCR三区，CCF B类，IF=2.4)
18. X Zeng, S Jin, J Jiang, Kh Han, Xp Min*, Xr Liu*, Predict the Relationship between Gene and Large Yellow Croaker's Economic Traits. Molecules, 2017, 22(11):1978，DOI: 10.3390/molecules22111978, (JCR三区，IF=3.0，Corresponding)
19. Yinyin Cai, Zhijun Liao,Ying Ju, Juan Liu, Yong Mao*, Xiangrong Liu*, Resistance gene identification from Larimichthys crocea with machine learning techniques, Scientific Reports, 2016,doi:10.1038/srep38367 ,(SCI,IF=5.2, Corresponding)
20. Jing Yang,Shuoxing Jiang, Xiangrong Liu, Linqiang Pan, Cheng Zhang, Aptamer-Binding Directed DNA Origami Pattern for Logic Gates, ACS Appl. Mater. Interfaces,2016, 8, 34054−34060, DOI: 10.1021/acsami.6b102662016, (JCR一区，IF=8.1)
21. Xiangxiang Zeng, You Li, Stephen C. H. Leung, Ziyu Lin, Xiangrong Liu*, Investment Behavior Prediction in Heterogeneous Information Network, NeuroComputing, 2016,DOI:10.1016/j.neucom.2015.12.139 (JCR二区，IF=3.24, Corresponding)
22. Jiancang Zeng, Dapeng Li, Yunfeng Wu, Quan Zou, Xiangrong Liu*, An empirical study of features fusion techniques for protein-protein interaction prediction, Current Bioinformatics,2016, DOI: 10.2174/1574893611666151119221435 (SCI，IF=0.54, Corresponding)
23. Te-Wei Chang, Xinhao Wang, Austin Hsiao, Zhida Xu, Guohong Lin, Manas Ranjan Gartia*, Xiangrong Liu*, Gang Logan Liu*, Bifunctional Nano Lycurgus Cup Array (NanoLCA) Plasmonic Sensor for Colorimetric Sensing and Surface-Enhanced Raman Spectroscopy (SERS), Advanced Optical Materials,2015, DOI: 10.1002/adom.201500092 (JCR一区, IF=7.43, Corresponding)
24. Xiangrong Liu, Juan Suo, Juan Liu, Yan Gao, Xiangxiang Zeng, Molecular Logic Computation with Debugging Method, Journal of Nanomaterials, 2015, DOI:10.1155/2015/120365 (JCR三区，IF=2.21)
25. Xiangrong Liu, Ziming Li, Xiangxiang Zeng, Implementation of Arithmetic Operations with Time-free Spiking Neural P Systems, IEEE Transactions on Nanobioscience,2015, DOI:10.1109/TNB.2015.2438257. (JCR三区，IF=2.16)
26. Xiangrong Liu, Juan Suo, Stephen CH Leung, Juan Liu, Xiangxiang Zeng, The Power of Time-free Tissue P Systems: Attacking NP-complete Problems, NeuroComputing, 2015,159(151-156), DOI: 10.1016/j.neucom.2015.01.072. (JCR二区，IF=3.24)
27. Tao Song, Quan Zou, Xiangrong Liu, Xiangxiang Zeng, Asynchronous Spiking Neural P Systems with Rules on Synapses, NeuroComputing, 2015, 152:1439-1445. (JCR二区，IF=3.24)
28. Xuewei Zhao, Quan Zou, Bin Liu, Xiangrong Liu *，Exploratory predicting protein folding model with random forest and hybrid features. Current Proteomics, 2014, 11(4), 289-299, DOI: 10.2174/157016461104150121115154.（SCI，IF= 0.61, Corresponding）
29. Xiangrong Liu, Ziming Li, Juan Suo ,Juan Liu, Xiaoping Min, A uniform solution to integer factorization using time-free spiking neural P system, Neural Computing and Applications, 2014, DOI: 10.1007/s00521-014-1799-2. (JCR三区，IF=4.21)
30. Xiangrong Liu, Runquan Xie, Chen Lin, Liujuan Cao, Question microblog identification and answer recommendation. Multimedia Systems, 2014, DOI: 10.1007/s00530-014-0411-z. (SCI，IF=1.7)
31. Sifa Xie, Wei Weng, Ke Chen, Xiangrong Liu*, Identifying Reliable Posts and Users in online Social Networks, International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence,2014, 28(6):1459007-1-17,DOI: 10.1142/S0218001414590071 (SCI,IF=1.0，Corresponding)
32. 刘向荣, 索娟, 柳娟, 李子铭, 曾湘祥, 体内生物分子计算系统的原理、进展和展望, 中国科学院院刊, 2014, 29(1):106-114.
33. Xinhao Wang, Manas Ranjan Gartia, Jing Jiang, Te-Wei Chang, Junle Qian, Yong Liu, Xiangrong Liu, Gang Logan Liu, Audio Jack Based Miniaturized Mobile Phone Electrochemical Sensing Platform, Sensors and Actuators B: Chemical , 2014, doi:10.1016/j.snb. (JCR一区,IF=5.667)
34. Tao Song, Xiangrong Liu, Xiangxiang Zeng, Asynchronous Spiking Neural P Systems with Anti-Spikes, Neural Process Letter, 2014, DOI :10.1007/ s11063-014-9378-1. (JCR三区，IF=1.787)
35. Xiangxiang Zeng, Lei xu, Xiangrong Liu, Linqiang Pan, On Language Generated by Spiking Neural P Systems with Weights, Information Sciences, 2014,278：423-433. (JCR一区，IF=4.3)
中国发明专利：
授权：
1. 刘向荣，龚瑞，毛勇，金烨楠，柳娟，曾湘祥，基于图像识别与级联分类器的对虾形态参数自动测量方法[P]， 201810180586.2
申请：
1. 刘向荣，俞心宇，胡冰，柳娟，潘婧，一种基于生物图像特征识别的溯源方法和溯源系统[P]，CN202011049842.8
2. 刘向荣，彭惠民，毛勇，程文志，一种基于边界约束卡尔曼滤波长时间多目标对虾跟踪方法[P]，CN202010485883.5
3. 刘向荣，彭惠民，柳娟，张悦，一种鲍鱼体型参数的图像测量方法[P]，CN202010493461.2
4. 刘向荣，谢少灵，柳娟，基于深度学习的河豚鱼个体识别方法[P]，CN202010207890.9
5. 刘向荣，李凯，柳娟，一种车库环境下基于77GHz毫米波雷达和视觉信息融合的目标检测方法[P]，CN202010208787.6
6. 汤敏丽,刘向荣,谢少灵，一种基于卷积神经网络的水书手写文字识别方法[P]，CN202010175808.9
7. 曾湘祥，杜妍孜，刘向荣，一种基于共识嵌入的复杂网络社区发现方法[P],CN 202010202056.0
8. 刘向荣，毛勇，龚瑞，柳娟，曾湘祥，基于卷积神经网络的对虾形态测量方法、介质、终端设备及装置[P]，CN20181063720.4
9. 刘向荣，刘敏，龚瑞，方旅平，徐嘉熠，詹讯，柳娟，基于深度学习的鱼类识别方法、介质、终端设备及装置[P]，CN20181063729.5
10. 刘向荣，柳娟，吴文彬，一种用于水产育种筛选的称量系统[P]，CN201910665509.0
11. 柳娟，吴文彬，刘向荣，一种提供开源数据接口的大批量称量电子秤[P]，CN201910665475.5
实用新型专利：
1. 柳娟,吴文彬,刘向荣，一种用于大批量称量的多功能传输电子秤，2019211641271（授权）
软件著作权：
1. 基于互联网+的便携式硝酸盐智能检测系统 V1.0，2017SR520933
2. 基于NFC标签的趣味智能旅游平台系统（简称：寻宝中国 ）V1.0，2017SR520928
3. 水产育种智能称量和数据处理软件（简称：快速种苗称重） V1.0, 2018SR543792
